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中藥科技基礎(chǔ)信息數(shù)據(jù)庫(kù)的研究與應(yīng)用
隨著中醫(yī)藥研究的不斷深化,工具書(shū)的不斷完善,中藥科技基礎(chǔ)信息數(shù)據(jù)庫(kù)的內(nèi)容也需不斷維護(hù)更新,下面是小編搜集整理的一篇相關(guān)論文范文,歡迎閱讀查看。
“中藥科技基礎(chǔ)信息數(shù)據(jù)庫(kù)”的建庫(kù)理念是建立可提供結(jié)構(gòu)型、規(guī)范性標(biāo)準(zhǔn)化中藥科技基礎(chǔ)數(shù)據(jù),支持用戶多用途、多途徑、多層次檢索查詢、中藥數(shù)據(jù)挖掘的結(jié)構(gòu)型中藥基礎(chǔ)數(shù)據(jù)庫(kù),為中醫(yī)藥科研、臨床、教育、管理、生產(chǎn)開(kāi)發(fā)等各類(lèi)人員提供中藥單味藥、中藥資源品種、中藥化學(xué)成分、中藥藥理、中藥臨床藥理、中藥毒理、炮制品等規(guī)范化的基礎(chǔ)數(shù)據(jù),可進(jìn)行關(guān)聯(lián)查詢的新型檢索工具。
【關(guān)鍵詞】 數(shù)據(jù)庫(kù);中藥科技基礎(chǔ)信息庫(kù);中藥知識(shí)挖掘
1 中藥科技基礎(chǔ)信息數(shù)據(jù)庫(kù)的結(jié)構(gòu)
1.1 中藥科技基礎(chǔ)信息數(shù)據(jù)庫(kù)遠(yuǎn)程錄入程序
中藥科技基礎(chǔ)信息數(shù)據(jù)庫(kù)目前有8張庫(kù)表,即:?jiǎn)挝端、品種、生藥材鑒定、中藥藥理、中藥毒理、中藥臨床藥理、化學(xué)成分、炮制品,分別設(shè)有:14、17、26、30、18、26、27、14共172個(gè)字段。每張庫(kù)表即可成為一個(gè)獨(dú)立的個(gè)體,又與各表間有著一定的內(nèi)在關(guān)聯(lián),使之成為一個(gè)有機(jī)的整體。
中藥科技基礎(chǔ)信息數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)構(gòu)以“單味藥”為主表,二級(jí)表有:品種、生藥材鑒定、中藥藥理、中藥毒理、中藥臨床藥理、化學(xué)成分、炮制品。
該庫(kù)遠(yuǎn)程編輯加工的界面能夠在很大程度上組織起一個(gè)中醫(yī)藥信息系統(tǒng),容納了中草藥中的大量知識(shí)。該系統(tǒng)設(shè)計(jì)了遠(yuǎn)程錄入程序botany,這個(gè)程序采用了不同的數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)構(gòu),具有較強(qiáng)的容錯(cuò)性,提供數(shù)據(jù)的遠(yuǎn)程錄入和維護(hù)、多用戶分級(jí)分權(quán)限管理、表查詢字段管理、人員錄入工作量統(tǒng)計(jì)等功能。
1.1.1 標(biāo)準(zhǔn)表的建立
在中醫(yī)藥數(shù)據(jù)中,存在著一些專(zhuān)用的標(biāo)準(zhǔn)詞匯,對(duì)這些詞匯的引用和管理一直以來(lái)沒(méi)有很好的技術(shù)支持。為此,該系統(tǒng)設(shè)計(jì)開(kāi)發(fā)了標(biāo)準(zhǔn)表管理程序,提供了對(duì)標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)的統(tǒng)一管理和規(guī)劃。其功能包括標(biāo)準(zhǔn)表的創(chuàng)建,標(biāo)準(zhǔn)表的刪除以及對(duì)標(biāo)準(zhǔn)表數(shù)據(jù)的添加、刪除、修改以及向標(biāo)準(zhǔn)表中批量導(dǎo)入輸入。
基于中藥科技基礎(chǔ)信息數(shù)據(jù)庫(kù)的結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)關(guān)系我們建立了33張標(biāo)準(zhǔn)表,標(biāo)準(zhǔn)表的設(shè)立引導(dǎo)了與關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)項(xiàng)的關(guān)聯(lián)。見(jiàn)表1。表1 中藥科技基礎(chǔ)信息庫(kù)的標(biāo)準(zhǔn)表(略)
1.1.2 數(shù)據(jù)來(lái)源
以“中藥數(shù)據(jù)庫(kù)”為基礎(chǔ)數(shù)據(jù),以權(quán)威工具書(shū)《中華本草》、《中華人民共和國(guó)藥典》、《中國(guó)常用中藥材》、《中國(guó)藥材學(xué)》、《中藥現(xiàn)代研究與臨床應(yīng)用》、《現(xiàn)代中藥栽培養(yǎng)植與加工手冊(cè)》、《常用中藥成分與藥理手冊(cè)》、《植物活性成分辭典》、《天然活性成分簡(jiǎn)明手冊(cè)》、《中藥炮制學(xué)》以及普通高等教育中醫(yī)藥類(lèi)規(guī)劃教材為數(shù)據(jù)依據(jù)。
1.1.3 質(zhì)量控制
該課題組先后制定了“中藥基礎(chǔ)庫(kù)界面編輯標(biāo)準(zhǔn)”、“中藥基礎(chǔ)庫(kù)操作手冊(cè)”、“中藥藥理補(bǔ)充說(shuō)明”、“中毒理及中藥臨床藥理樣本”、“中藥炮制學(xué)說(shuō)明”、“中藥炮制學(xué)加工工藝標(biāo)準(zhǔn)”,為數(shù)據(jù)制作奠定了基礎(chǔ)。
中藥科技基礎(chǔ)信息庫(kù)的完成數(shù)據(jù)量:?jiǎn)挝端?1 013條、化學(xué)成分5 944條、品種8 199條、生藥材鑒定4 350條、中藥藥理5 407條、中藥臨床藥理632條、中藥毒理1 160條、炮制品375條,總計(jì)37 080條。
1.2 中藥科技基礎(chǔ)信息數(shù)據(jù)庫(kù)導(dǎo)入程序
本系統(tǒng)為面對(duì)管理人員的管理系統(tǒng)(Magic)。目前支持導(dǎo)入遠(yuǎn)程錄入的有8張表:“單味藥、化學(xué)成分、品種、生藥材鑒定、一般藥理、一般臨床藥理、一般毒理、炮制品”。登陸以后進(jìn)入主界面,選擇需要導(dǎo)入的表,就進(jìn)入相應(yīng)表的導(dǎo)入界面。每個(gè)表的導(dǎo)入界面都是一樣的:最上面是一些篩選條件,用來(lái)選擇需要導(dǎo)入的記錄;中間是將要導(dǎo)入的記錄,為了簡(jiǎn)單起見(jiàn)(遠(yuǎn)程界面提供添加、修改、刪除全套功能),只顯示了1個(gè)ID、1個(gè)相關(guān)字段(如中藥名稱等)和一些附加信息(錄入人員、狀態(tài)標(biāo)志等);最下面是記錄導(dǎo)入的統(tǒng)計(jì)和控制。在導(dǎo)入時(shí)要先填入篩選條件,然后點(diǎn)擊統(tǒng)計(jì)生成要導(dǎo)入的記錄集,才能進(jìn)行數(shù)據(jù)的導(dǎo)入。
此外,Magic附帶了統(tǒng)計(jì)錄入人員工作量的功能,在主界面點(diǎn)擊統(tǒng)計(jì)工作量即可。
1.3中藥科技基礎(chǔ)信息數(shù)據(jù)庫(kù)導(dǎo)航系統(tǒng)
中藥科技基礎(chǔ)信息數(shù)據(jù)庫(kù)的導(dǎo)航系統(tǒng)包含了幾十張大型復(fù)雜的數(shù)據(jù)表,其拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)之復(fù)雜、數(shù)據(jù)格式的多樣化以及表與表之間的關(guān)系紛繁錯(cuò)雜是中醫(yī)藥學(xué)科固有的特性。為了能實(shí)現(xiàn)這些表數(shù)據(jù)之間的導(dǎo)航,設(shè)計(jì)了BaseView網(wǎng)頁(yè)導(dǎo)航系統(tǒng)。該系統(tǒng)將錯(cuò)綜復(fù)雜的表結(jié)構(gòu)及其關(guān)系通過(guò)網(wǎng)頁(yè)聯(lián)接起來(lái),實(shí)現(xiàn)了數(shù)據(jù)相關(guān)性的良好導(dǎo)航。
該導(dǎo)航系統(tǒng)查詢是以查詢類(lèi)別對(duì)應(yīng)相應(yīng)的查詢內(nèi)容的導(dǎo)航系統(tǒng),可以進(jìn)行精確與模糊兩種查詢。查詢類(lèi)別設(shè)有“單味藥、品種、炮制品、藥理作用、化學(xué)成分”。查詢單味藥主表可直接查詢到11個(gè)相關(guān)聯(lián)關(guān)系。
從查詢類(lèi)別五大板塊查詢,可查詢與五大板塊相對(duì)應(yīng)的每個(gè)主題的關(guān)系項(xiàng),如“單味藥”對(duì)應(yīng)本庫(kù)表14項(xiàng)與之關(guān)聯(lián)的內(nèi)容。以此類(lèi)推,“品種”對(duì)應(yīng)本庫(kù)表17項(xiàng)、“炮制品”對(duì)應(yīng)本庫(kù)表14項(xiàng)、“中藥藥理”對(duì)應(yīng)本庫(kù)表30項(xiàng)、“中藥化學(xué)成分”對(duì)應(yīng)本庫(kù)表27項(xiàng),這樣查詢點(diǎn)共有102個(gè)。與102個(gè)查詢點(diǎn)相關(guān)聯(lián)的庫(kù)表可進(jìn)行系列關(guān)聯(lián)查詢。
2 中藥科技基礎(chǔ)信息數(shù)據(jù)庫(kù)的應(yīng)用及歸類(lèi)
2.1 中藥科技基礎(chǔ)信息數(shù)據(jù)庫(kù)的應(yīng)用
以“紅花”為例,按“單味藥”查詢,選擇后在相應(yīng)中藥名稱處填“紅花”,查詢結(jié)果見(jiàn)表2。表2 以“紅花”為例查詢所得結(jié)果(略)
“中藥科技基礎(chǔ)信息數(shù)據(jù)庫(kù)”關(guān)聯(lián)查詢以紅花為例:從該表進(jìn)入查詢類(lèi)別,可以按“單味藥、品種、炮制品、藥理作用、化學(xué)成分”查詢?傻玫脚c“紅花”單味藥的數(shù)據(jù)相關(guān)聯(lián)的其他數(shù)據(jù),如品種、藥理、毒理、臨床藥理、功效、歸經(jīng)、性味、疾病、化學(xué)成分、配伍、炮制品等11種關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù),并可進(jìn)一步深入關(guān)聯(lián)。見(jiàn)表3。這時(shí)我們得到該藥的品種數(shù)據(jù)并與之相關(guān)的生藥材鑒定方法、該品種的單味藥、該品種的科屬類(lèi)別。以生藥材鑒別為例,見(jiàn)表4。表3 以“紅花”為例進(jìn)一步深入關(guān)聯(lián)查詢結(jié)果(略)表4 “紅花”生藥材鑒別查詢(略)
通過(guò)查詢我們了解到紅花藥材的一系列信息,如果進(jìn)入“藥理”表或“臨床藥理”表,又會(huì)從另一點(diǎn)而展開(kāi),最終又回到基點(diǎn)上,即由點(diǎn)到面,由面到點(diǎn)多重關(guān)聯(lián)的查詢,充分體現(xiàn)了中藥科技基礎(chǔ)信息的特性。
2.2 中藥科技基礎(chǔ)信息數(shù)據(jù)庫(kù)的歸類(lèi)查詢
中藥科技基礎(chǔ)信息庫(kù)單味藥歸類(lèi)項(xiàng);化學(xué)成分、疾病、功效、性味、歸經(jīng)、品種,化學(xué)成分歸類(lèi)項(xiàng):功效、單位藥。
以單味藥大黃的性味歸類(lèi)為例,從“單味藥”進(jìn)入精確查詢,然后進(jìn)入“大黃”相關(guān)聯(lián)的“該性味的單味藥”,得到:“苦”、“寒”中藥藥性。查詢順序是:?jiǎn)挝端帲捍簏S,精確查詢-查詢?cè)斍?性味:大黃-該單味藥的性味:苦、寒。我們?cè)僖孕晕?ldquo;苦”為例,點(diǎn)擊“苦”,再連續(xù)進(jìn)入具備該性味的“單味藥”,得到具有性味“苦”的單味藥有4 275條,如芙蓉麻、芙蓉菊根、扶栘木皮、扶桑金星蕨、。扶芳藤、伏;、佛手柑根、鳳仙透骨草、鳳仙根、鳳仙、鳳尾豬鬃草、鳳尾搜山虎、鳳凰毛、縫線石楠、蜂窩草、蜂斗菜、楓香樹(shù)根、楓柳皮、風(fēng)箱樹(shù)葉、風(fēng)箱樹(shù)花、風(fēng)箱樹(shù)根、風(fēng)花菜、豐滿鳳仙花、豐花草、糞箕篤、粉團(tuán)花、粉萍婆、粉綠藤、粉苞苣、分心木、肺形草、榧花、肥豬苗、肥肉草、非洲戴星草、飛天蠄蟧、飛來(lái)藍(lán)、飛海蛾、飛蛾樹(shù)、防風(fēng)草、滇雞骨常山、毛貫眾等。
按其歸類(lèi)項(xiàng)查詢,還可根據(jù)需求對(duì)其單味藥的其他歸類(lèi)項(xiàng)進(jìn)行歸類(lèi),為中藥的知識(shí)挖掘提供了一個(gè)強(qiáng)大的中藥科技基礎(chǔ)信息數(shù)據(jù)平臺(tái)。
3 中藥科技基礎(chǔ)信息數(shù)據(jù)庫(kù)維護(hù)與完善
隨著中醫(yī)藥研究的不斷深化,工具書(shū)的不斷完善,中藥科技基礎(chǔ)信息數(shù)據(jù)庫(kù)的內(nèi)容也需不斷維護(hù)、更新、充實(shí)。其中一些數(shù)據(jù)需進(jìn)行結(jié)構(gòu)化處理,如“生藥材鑒定”中的:“藥材鑒別、理化鑒別、顯微鑒別、色譜鑒別、光譜鑒別”等字段,“品種”表中的“藥材栽培”這部分?jǐn)?shù)據(jù)的結(jié)構(gòu)化目前也具備了一定的條件。中藥科技基礎(chǔ)信息數(shù)據(jù)庫(kù)“生藥材鑒定”、“品種”表,若進(jìn)一步結(jié)構(gòu)化后,對(duì)于中藥材科研及生產(chǎn)以及市場(chǎng)需求,可提供有效的基礎(chǔ)信息。在不斷的優(yōu)化進(jìn)程中,統(tǒng)計(jì)功能也將得到完善。
4 結(jié)語(yǔ)
中藥科技基礎(chǔ)信息數(shù)據(jù)庫(kù)依托在一個(gè)功能極其強(qiáng)大的Oracle9I數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)平臺(tái)上,它具有較強(qiáng)的關(guān)聯(lián)查詢功能。中藥基礎(chǔ)數(shù)據(jù)庫(kù)超越了單類(lèi)別工具書(shū)的局限性,也摒除了單表型中藥數(shù)據(jù)庫(kù)的單一性,它綜合了中藥學(xué)相關(guān)學(xué)科的特性,組成了一個(gè)強(qiáng)大的中藥學(xué)體系,即宏觀,又微觀,具有任意、快捷、獲取最有效規(guī)范化標(biāo)準(zhǔn)的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)的優(yōu)勢(shì)。
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