東南大學(xué)計算機科學(xué)與工程學(xué)院起源于1960年建立的“解算裝置及技術(shù)”專業(yè)，曾自主研制我國第一臺數(shù)字積分機，填補了國內(nèi)空白，并成功地應(yīng)用于國防現(xiàn)代化和工業(yè)自動化領(lǐng)域，取得了開創(chuàng)性成果。1960年開始招收本科生，1979年開始招收碩士研究生，1990年開始招收博士研究生。1981年建立計算機科學(xué)與工程系，2006年建立計算機科學(xué)與工程學(xué)院。
　　目前，學(xué)院下設(shè)計算機科學(xué)系、計算機工程系和影像科學(xué)與技術(shù)系，擁有“計算機科學(xué)與技術(shù)”一級學(xué)科博士點，包括“計算機系統(tǒng)結(jié)構(gòu)”、“計算機軟件與理論”、“計算機應(yīng)用技術(shù)”全部3個二級學(xué)科博士點，以及“圖像處理與科學(xué)可視化”博士點。“計算機應(yīng)用技術(shù)”學(xué)科1994年被評為江蘇省重點學(xué)科，1999年設(shè)立教育部長江特聘教授崗，2002年被評選為國家重點學(xué)科，2007年順利通過國務(wù)院學(xué)位辦組織的評估，成為新一輪的國家重點學(xué)科。“計算機軟件與理論”2006年成為江蘇省重點學(xué)科。2001年國家人事部批準建立了東南大學(xué)“計算機科學(xué)與技術(shù)”一級學(xué)科博士后流動站。
　　學(xué)院現(xiàn)有教職工120余人，擁有一支結(jié)構(gòu)合理、充滿朝氣、以中青年教師為主的高水平師資隊伍。其中，長江學(xué)者特聘教授1人，教育部跨世紀、新世紀人才7人，江蘇省跨世紀學(xué)術(shù)帶頭人4人，江蘇省“333”工程中青年首席科學(xué)家1人，江蘇省“333”工程科技領(lǐng)軍人才2人，江蘇省“333”工程技術(shù)帶頭人2人，教育部青年骨干教師4人，江蘇省優(yōu)秀青年骨干教師5人，江蘇省優(yōu)秀教育工作者1人，教育部“長江學(xué)者和創(chuàng)新團隊發(fā)展計劃” 創(chuàng)新團隊1個，博士生導(dǎo)師18人，教授24人，副教授35人。2011年3月，新聘中國工程院院士、我國著名電子和通信技術(shù)專家李幼平為全職教授。
　　學(xué)院建有計算機網(wǎng)絡(luò)和信息集成教育部重點實驗室、江蘇省計算機網(wǎng)絡(luò)技術(shù)重點實驗室、江蘇省網(wǎng)絡(luò)與信息安全重點實驗室、中法生物醫(yī)學(xué)信息研究中心，以及國家863/CIMS“網(wǎng)絡(luò)與數(shù)據(jù)庫”工程實驗室、中國教育科研網(wǎng)華東（北）地區(qū)網(wǎng)絡(luò)中心等一批科研實驗基地，還建有東南大學(xué)CIMS技術(shù)中心、影像科學(xué)與技術(shù)實驗室、電子商務(wù)研究與開發(fā)中心、信息安全技術(shù)中心、未來網(wǎng)絡(luò)研究中心等交叉學(xué)科研究機構(gòu)。
　　學(xué)院注重加強科學(xué)研究，提高科技創(chuàng)新能力。近10年來，承擔了各類科研項目共200多項，其中國家自然科學(xué)基金、國家973、國家863、國家科技攻關(guān)、教育部和江蘇省等重要科研項目140多項，獲得國際工業(yè)領(lǐng)先獎1項、國家科技進步獎8項、部省級獎20多項，在國內(nèi)外著名的學(xué)術(shù)期刊和會議上發(fā)表論文1600多篇，其中SCI、EI、ISTP三大檢索850多篇次。在ESI學(xué)科排名中，學(xué)院水平已接近全球前1%。
　　學(xué)院始終以培養(yǎng)高水平人才為目標，根據(jù)人才培養(yǎng)目標定位和社會人才需求，精心制定本科生和研究生培養(yǎng)計劃，明確專業(yè)人才培養(yǎng)理念是“強化基礎(chǔ)、軟硬結(jié)合、立足系統(tǒng)、面向應(yīng)用、加強實踐”。計算機科學(xué)與技術(shù)專業(yè)成為首批江蘇省品牌專業(yè)，并成為國家特色專業(yè)建設(shè)點，還通過了教育部組織的國家工程教育專業(yè)認證。“計算機教學(xué)實驗中心”成為國家及江蘇省教學(xué)實驗示范中心建設(shè)點。“數(shù)據(jù)庫原理”成為國家精品課程。
　　經(jīng)過近五十年的建設(shè)，學(xué)院形成了以計算機網(wǎng)絡(luò)技術(shù)為特色，整個學(xué)科協(xié)調(diào)發(fā)展、快速發(fā)展的局面，在學(xué)科地位、科研水平、教學(xué)質(zhì)量、人才培養(yǎng)等方面居國內(nèi)前列。2005年“計算機應(yīng)用技術(shù)”學(xué)科名列全國第5，2007年“計算機科學(xué)與技術(shù)”學(xué)科名列全國第14。據(jù)中國科學(xué)評價研究中心發(fā)表的關(guān)于計算機科學(xué)與技術(shù)一級學(xué)科的評估報告，學(xué)院的本科生教育和研究生教育都被評為A+級，都名列全國第8。
　　“十二五”期間，學(xué)院將以學(xué)科建設(shè)為中心，大力加強科學(xué)研究、人才培養(yǎng)和國際合作，重點鞏固并不斷提升計算機應(yīng)用技術(shù)國家重點學(xué)科水平，努力將計算機軟件與理論發(fā)展成為國家重點學(xué)科，進一步優(yōu)化和發(fā)展圖像處理與科學(xué)可視化學(xué)科，積極發(fā)展計算機系統(tǒng)結(jié)構(gòu)學(xué)科，整體推進計算機科學(xué)與技術(shù)一級學(xué)科國家重點學(xué)科建設(shè)，爭取在ESI學(xué)科排名中進入全球前1%。構(gòu)建一支規(guī)模適度、結(jié)構(gòu)優(yōu)化、領(lǐng)軍人才突出、創(chuàng)新能力強、團結(jié)協(xié)作的師資隊伍；不斷增強科技創(chuàng)新能力，努力建設(shè)國家級研究與實驗平臺；參照國際標準，創(chuàng)新人才培養(yǎng)模式，大力提高人才培養(yǎng)質(zhì)量；加強廉政建設(shè)，切實改善與提高師生員工的生活、學(xué)習(xí)和工作條件，調(diào)動各方面的積極性，建設(shè)和諧學(xué)院。